Asociacija „Santakos slėnis" įgyvendina Slėnio tikslus, derina Slėnio partnerių interesus ir jiems atstovauja, aprobuoja Slėnio plėtros dokumentus tarp Slėnio partnerių, koordinuoja Slėnio plėtrą ir Slėnio plėtros programos įgyvendinimą, prioritetizuoja veiklą ir projektus. Žin. 2008, Nr. 134-5201, LRV nutarimas.